MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-4 DNA

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020822	GT	3	6	49	54	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020822	GCT	2	6	65	70	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020822	AAG	2	6	256	261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020822	T	6	6	281	286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020822	T	6	6	1771	1776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020822	ATGT	2	8	1794	1801	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020822	CAG	2	6	1829	1834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020822	ATT	2	6	1887	1892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020822	CTT	2	6	1948	1953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020822	TAT	2	6	1962	1967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020822	CAA	2	6	1981	1986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020822	GTA	2	6	2022	2027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020822	ACAAA	2	10	2028	2037	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_020822	T	6	6	2906	2911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020822	C	7	7	3564	3570	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_020822	TTTC	2	8	3607	3614	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_020822	TAA	3	9	4736	4744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020822	T	8	8	5230	5237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020822	TCAA	2	8	5307	5314	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020822	CAT	2	6	5648	5653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020822	ATA	2	6	5714	5719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020822	C	6	6	5726	5731	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_020822	TGA	2	6	5771	5776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020822	GTA	2	6	5779	5784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020822	TAA	2	6	5810	5815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020822	ATA	2	6	5829	5834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020822	CAA	2	6	5864	5869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020822	T	6	6	5913	5918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020822	TAA	2	6	5922	5927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020822	A	6	6	5926	5931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020822	T	6	6	5957	5962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020822	TCAAG	2	10	5999	6008	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_020822	GAT	2	6	6015	6020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020822	CAG	2	6	6978	6983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020822	TAGC	2	8	7087	7094	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020822	GTC	2	6	7132	7137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020822	T	6	6	7177	7182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020822	CA	3	6	7218	7223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020822	CCAC	2	8	7233	7240	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_020822	TGA	2	6	7245	7250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020822	T	6	6	7261	7266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020822	TAAGT	2	10	7270	7279	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020822	ATTG	2	8	7286	7293	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020822	TGTA	2	8	7348	7355	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020822	ATA	2	6	7384	7389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020822	T	6	6	7396	7401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020822	GTC	2	6	7455	7460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020822	GAT	2	6	8679	8684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020822	TCT	2	6	8727	8732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_020822	AAC	2	6	8876	8881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020822	A	7	7	8912	8918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020822	CACC	2	8	8919	8926	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
53	NC_020822	TAT	2	6	8973	8978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020822	CGAC	2	8	9313	9320	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020822	TGA	2	6	9478	9483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020822	TCC	3	9	9819	9827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_020822	GTT	2	6	9859	9864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020822	GCC	2	6	9897	9902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_020822	A	6	6	9929	9934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020822	T	6	6	9960	9965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020822	CAA	2	6	10060	10065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020822	AGA	2	6	10460	10465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020822	GTA	2	6	10582	10587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020822	GTA	3	9	10593	10601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020822	AAAG	2	8	10602	10609	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020822	AAGTTA	2	12	12007	12018	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020822	CAG	2	6	12026	12031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020822	TGT	2	6	12080	12085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020822	A	6	6	12096	12101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020822	ACA	2	6	12127	12132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020822	GAA	2	6	12133	12138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020822	ACT	2	6	14275	14280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020822	TTA	2	6	14292	14297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020822	GAG	2	6	14401	14406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020822	ATTTA	2	10	14564	14573	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020822	TAA	2	6	14643	14648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020822	ATT	2	6	14680	14685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020822	TAA	2	6	15639	15644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020822	T	7	7	15693	15699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020822	GAG	2	6	15725	15730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020822	ATT	2	6	15810	15815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020822	CCTCA	2	10	15831	15840	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
83	NC_020822	TAT	2	6	15885	15890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020822	TTCC	2	8	21968	21975	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_020822	TAT	2	6	22001	22006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020822	A	6	6	22082	22087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020822	A	7	7	22168	22174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020822	CTTG	2	8	22189	22196	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_020822	CAA	2	6	22242	22247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_020822	A	6	6	22313	22318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020822	TAA	2	6	22333	22338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020822	T	6	6	22376	22381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020822	AAT	2	6	22396	22401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020822	AGG	2	6	22461	22466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020822	TTA	2	6	23259	23264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.